只有正确了解并掌握复合肥结块的原因才能采取合适的方法阻止肥料的结块。经对物质颗粒表面使用电镜和X光衍射技术进行观察和研究，目前公认的是晶体桥连理论和毛细管吸附理论。
　　1）晶体桥连理论
　　晶体桥连理论认为由于自身（晶体性质、化学组成、粒度、粒度分布、晶体的几何尺寸）和外界条件（湿度、温度和压力）的变化，水分不断从内部向粒表扩散（或因表面吸湿），促使颗粒表面溶解、重结晶，从而在颗粒间隙处形成晶体架桥，随着时间的推移，这些晶桥彼此之间互相结合，逐渐形成大的团块。
　　(2)毛细吸附理论
　　该理论认为:具有吸湿性的肥料在其临界相对湿度(又称吸湿点，简写为CRH，用它来表示肥料的吸湿性，即在一定温度下，肥料开始向空气中吸水或失水时的空气相对湿度)以上吸收水份，在晶体表面形成肥料的饱和溶液膜。这种溶液膜加速了毛细吸附，毛细管弯月面上的水的饱和蒸气压低于外部的饱和蒸气压，外部水蒸气扩散至颗粒间，从而吸湿潮解，由表面张力形成的凹面使离子向颗粒接触处移动，导致相邻颗粒间形成交联和粘结成团块。
　　晶体桥连理论和毛细管吸附理论可以解释许多无机化合物的结块现象，二者都认为肥料结块的原因是表面先被溶解之后继发重结晶，从而使小晶粒结合成团。
　　（3）化学反应理论
　　该理论认为:化肥在造粒过程中不可能完全反应，但在贮存过程中会继续反应生成复盐，从而引起重结晶和结块。这些反应伴随着放热与释放水分，使复盐组分发生变化，导致颗粒体积的改变，造成产品出现崩裂粉化和结块。
　　随着对高浓度复合肥结块的研究，形成了塑性变形理论。
　　(4)塑性变形理论
　　该理论认为，结块伴随着形变，形变又会因受压而加剧;未经彻底冷却的化肥的残余热量会从颗粒中心向外转移，如果这时化肥颗粒受到挤压就可导致形变，进而结块。
　　(5)扩散结块理论
　　以上机理比较成熟，但原苏联一些学者提出了一种完全不同的结块理论——扩散结块机理。扩散结块机理认为无机化合物的结块取决于颗粒形状或颗粒堆积形成的孔道结构，无机物的离子正是通过这些孔道进行自扩散，在颗粒表面发生某种物理或化学作用而呈结块现象。